Международное сотрудничество осуществляется под руководством Международного управления КГТУ.
Основными направлениями деятельности являются:
БГАРФ ФГБОУ ВО «КГТУ» является полномочным членом Международной ассоциации морских университетов — International Association of Maritime Universities and Inland Navigation Universities.
В академии обучаются студенты из Египта, Марокко, Туниса, Сирии, Кабо-Верде и Кубы.
Дипломы Балтийской академии рыбопромыслового флота признаны на международном уровне.
Академия поддерживает партнёрские отношения с высшими морскими школами: